发展历程

目前，一些仪器公司的自带软件可以对三维荧光进行初步的分析，如堀场（HORIBA）公司的Aqualog自带的软件基于Origin软件开发了可对数据进行空表扣减、内滤效应校正、散射消除等数据前处理的功能，简化了数据处理的流程。Eigenvector Research Inc. (EVRI)公司开发的商业化软件Solo可以实现对EEM的PARAFAC分析。以上软件有很好的操作界面，不过需要密匙才能使用，限制了用户，尤其是学术界用户的使用。美国佐治亚大学（University of Georgia）的Wade Sheldon基于Matlab开发的FLToolbox软件包具有较好的界面，可实现对EEM散射峰的消除和显示EEM数据（等值线图和三维图景）（Zepp et al., 2004）。澳大利亚新南威尔士大学（The University of New South Wales）的Murphy et al基于Matlab开发了FDOMcorret程序代码用于程序化的处理EEM数据，包括仪器波长校正、背景（空白）扣减、内滤效应（含自吸收）校正、拉曼校正和硫酸喹啉校正等步骤，以期保证多种仪器测定的数据的准确性和可比性（Murphy et al., 2010）。在PARAFAC程序包的开发方面，丹麦哥本哈根大学(University of Copenhagen)的Stedmon and Bro推出了基于Matlab N-way toolbox软件包的DOMFLuor软件包（Stedmon and Bro, 2008），并与Murphy合作推出了drEEM软件包（Murphy et al., 2013），前者专门用于EEM的PARAFAC分析，后者又加入了数据导入功能、EEM显示功能和FDOMcorrect程序代码的一些功能，提高了一定的用户体验。为了实现利用已知PARAFAC模型拟合新EEM数据集，Fellman et al. (2009)编写了Matlab代码。为了实现用户PARAFAC模型与已知文献模型的定量比较，Parr et al. (2014)基于R语言编写了比对代码comPARAFAC，而He et al. (2015)基于Matlab编写了比对代码comparafac，两者均为用户开展模型间的比较提供了工具。

值得注意的是，当前的荧光数据处理的非商业化软件和代码（图2）仍存在一些问题：（1）界面友好的软件但是功能尚不齐全，如FLtoolbox，不具备开展平行因子分析的功能；（2）功能强大但界面不够友好，如drEEM toolbox，基于DOMfluor有了很大的改进，可以实现PARAFAC分析，但是对于不熟悉Matlab语言的人来说，学习需要花费一定的时间；（3）仅有代码，不利于方法的推广，如comPARAFAC和拟合PARAFAC模型代码，这些代码在运行时出现状况，往往使得研究无法进行，对于不了解Matlab语言的用户来说无法识别代码中可能存在的不兼容或者错误表达等。

本软件针对上述问题，吸取了上述软件或代码的优势部分，解决了以上软件存在的理论缺失和用户体验差的问题，是一款专门用于三维荧光数据前处理和开展平行因子分析的软件，受用人群涵盖了工业界和学术界的研究者。

图2 三维荧光数据处理相关非商业化软件与代码